El Puerto de Ensenada se localiza al Noroeste del Pacífico Mexicano, 110 Km. al Sur de la frontera con California, Estados Unidos. Sus coordenadas son 31º 51' Latitud Norte y 116º 38' Longitud Oeste. Se conecta al Norte y Sur con la carretera federal no.1 y al Este con la carretera federal No. 3.

Dentro de un radio de acción de más de 1500 Km., las principales vialidades carreteras conectan al puerto principalmente con las ciudades de Tijuana, Tecate, Mexicali y Hermosillo en México, y con las ciudades fronterizas de los EUA, San Diego, Los Ángeles, Tucson, Yuma y Phoenix en Arizona.

Para el movimiento por tierra de la carga que tiene como origen o destino el puerto, las tres vías de mayor importancia son la autopista Tijuana-Ensenada y las carreteras federales Tijuana-Ensenada y Tecate-Ensenada. La autopista es de altas especificaciones (4 carriles y 2 cuerpos) y a través de la misma se transportan los mayores flujos de carga manejados. Las tres vías indicadas son los enlaces básicos para comunicar al Puerto con la red carretera principal de los Estados Unidos de América.